تترابط الحموض الأمينية فيما بينها بروابط ببتيدية ، ويتم الارتباط بحذف جزيء ماء بين كل حمضين أمينين من مجموعة الكربوكسيل ومجموعة الأمين .
ـ وعند ارتباط حمضين أمينين يسمى الناتج ثنائي الببتيد Dipeptide
ـ وعند ارتباط ثلاثة حموض أمينية يسمى الناتج ثلاثي الببتيد Tripeptide
ـ وإذا ارتبط عدد كبير من الحموض الأمينية تنتج سلسلة بروتين ، أي مبلمراً عديد الببتيد Polypeptide 

 مثال :
يرتبط غلايسين مع ألانين برابطة ببتيدية لتكوين ثنائي ببتيد :

 إن اختلاف تتابع الحموض الأمينية يؤدي إلى اختلاف ثنائي الببتيد.
والبروتينات المكونة لأجسام الكائنات الحية تعد بالآلاف وهي مبنية من عشرين حمضاً أمينياً. ويعتمد اختلاف هذه البروتينات على ثلاثة عوامل :
 ـ نوع الحموض الأمينية في السلسلة .
 ـ عدد الحموض الأمينية في السلسلة .
 ـ تتابع الحموض الأمينية في السلسلة .